一、藥廠廠房工藝設計與與設備專業的關系
工藝與設備專業聯系密切，工藝過程要靠設備來完成運行。設備分定型設備和非標準設備。定型設備由工藝專業負責選型；非標準設備由工藝專業確定外形尺寸、管口方位、工藝參數等，并向設備專業提出條件。設備專業接受條件后，完成設備設計總圖，然后向工藝專業返回條件。
二、藥廠廠房工藝設計與與自控的關系
工藝過程的先進程度與設備選型有關，也與工藝過程控制有關。工藝在完成工藝流程圖后向自控專業提出條件，內容包括控制手段、控制參數、介質特性、儀表安裝方式等。自控專業接受條件后，對有關儀表進行計算和選擇，針對工藝條件中的內容與工藝協商，達到共識后，再將工藝流程圖進行修改、完善為管道及儀表流程圖，并完成自己的專業設計成品。
三、藥廠廠房工藝設計與與土建的關系
工藝依據總圖專業提出的總平面布置條件，進行車間工藝布置設計，在完成工藝流程圖、工藝設備布置圖后，向土建專業提出條件，內容包括對廠房的要求（開間、跨度、層高等）、設備位置及重量、吊車噸位、設備支撐方式、防火要求、防爆要求、防腐要求、定員、衛生等級、潔凈度等級、振動、潮濕、開孔尺寸（300mm以上）等。土建專業在接受工藝的一次條件后開始建筑設計，繪制建筑平面圖、立面圖、剖面圖，并向工藝專業返回一次條件；同時，結構專業開始結構設計，并將結構基礎圖、結構平面圖作為條件向工藝專業提出。接到建筑結構條件后，工藝專業開展管道設計，同時完善設備布置，最后工藝專業向土建專業提出二次條件，內容包括樓面30mm以下、墻面400mm以下預留孔及管道支架的預埋件和設備基礎，建筑結構專業完成土建施工設計文件。
四、土建與公用工程專業
土建專業在完成總平面布置、建筑平面圖、建筑立面圖、建筑剖面圖和結構基礎圖、結構平面圖后，向公用工程專業提出一次條件，在收到條件后，公用工程專業即可開展施工圖設計，在完成一定深度后，再向土建專業返回條件然后，土建專業完善施工圖設計。
五、土建專業之間
建筑專業在完成建筑平面圖、立面圖、剖面圖后，向結構專業和總圖專業提出一次條件，經協商達成共識后，結構專業開展結構基礎設計和結構平面設計，總圖專業完善施工圖設計。
六、公用工程專業之間
在收到工藝一次條件后，公用工程專業即可開展計算和方案設計空調、冷凍、采暖專業在完成計算和設備選型后，先向給排水專業、熱力專業提出條件。給排水專業和熱力專業在完成計算和設備選型后，再向電氣專業提出條件，電氣專業收到條件后，即可開展施工圖設計，其他專業可繼續完善施工圖設計。