高效過濾器通常是在地面施工完畢后才進行安裝，這樣做室內條件符合高效過濾器的安裝條件。如果地面采用環氧樹脂自流平材料，這樣做存在一個問題，就是在做環氧樹脂自流平地面時，室內無法通風，對施工人員的健康非常有害。所以，施工人員常常開門通風，甚至用鼓風機通風，這樣通風既影響地面施工質量，又會污染潔凈室，給日后擦洗帶來困難。作者認為，在環氧樹脂自流平地面的底涂施工完畢并干燥后，即可進行高效過濾器的安裝。因為底涂以后，地面已經很干凈，符合高效過濾器的安裝條件。裝好高效過濾器后，在地面的中涂及面涂施工時，就可利用凈化空調系統進行通風換氣，地面涂裝的施工環境得到改善，更重要的是可提高地面的光潔度（這種涂裝地面的環境比汽車烤漆房的潔凈度還高）。這種施工工序，既不影響高效過濾器的安裝質量，又能提高地面施工質量且能確保工人的健康，可謂一舉三得，應該提倡。
安裝高效空氣過濾器前，潔凈室裝修工程及安裝工程應全部完工，并且應對潔凈室進行全面清掃、擦洗。根據規范要求，凈化空調系統必須進行試運轉，且須連續試運轉（空吹）12～24h，空吹后再次清掃、擦洗潔凈室，這時工人須穿干凈工作服及工作鞋，立即進行高效空氣過濾器的安裝。
在地面底涂完工后，撕去封堵在高效送風口上的塑料薄膜，起動空氣凈化系統，先吹30min，然后關機，再撕去彩鋼板上的保護膜。先運轉30min是由于系統中的塵埃大部分在前半小時內即可吹出，并且有一部分附著在室內壁面上，有一部分經回風口進入回風管道，最后進入組合式空調機組經過粗效、中效兩級過濾器過濾，再進入潔凈室，如此循環。若此時吹得時間太長，由于室內氣流的擾動，會把已附著在壁面及地面上的塵埃吸入回風管，雖然回風口裝有過濾層，但其過濾能力是有限的，塵埃必然會穿過回風口過濾層被空調機組內的粗、中效過濾器捕獲前附著在回風管道內，增加了回風系統內的污染。故在空吹30min后，及時撕掉彩鋼板上的覆膜，連同所附著的塵埃一并清除。撕掉覆膜后，再次清潔地面，最后再連續空吹12～24h。作者認為空吹時間也不宜太長，有12h足夠。因為附著在風管內壁的塵埃并不隨空吹時間的延長而減少太多。作者曾在風管清掃口做過試驗，有意在清掃口的密閉門上附著一些塵埃，在空吹12h和空吹2h后分別檢查密閉門上的塵埃，發現二者并無明顯區別。所以，作者認為風管系統的清潔，最好是在制作風管時除去其內壁的油污及塵埃，這是最根本的措施。空吹只能吹走一部分浮塵。空吹結束后，再次清潔室內墻壁、頂棚及地面，隨后即可安裝高效空氣過濾器。