一、生鮮食品廠的廢棄物處理
食品廠廠房通道及周圍場地不得堆放雜物，保持清潔生鮮食品加工車間和其他工作場地的廢棄物必須隨時清除，并及時清理出廠。廢棄物容器和廢棄物存放場地應及時清洗、消毒。
二、生鮮食品廠的蟲害物控制
生鮮食品廠的所有加工設施都要執行蟲害控制計劃，以除去如老鼠、鳥、爬蟲動物和昆蟲等有害物。這些有害物往往是多種病原體的棲息地或攜帶者。
1、食品廠廠區周圍應定期或在必要時進行除蟲滅害，防止害蟲孳生。
2、車間內使用殺蟲劑時，應按衛生部門的規定采取妥善措施，不得污染原料、半成品和成品；并應盡量避免污染設備、工器具和容器使用殺蟲劑后應將設備、工器具和容器徹底清洗，除去殘留藥物
3、安裝紗窗，并在所有門上使用門簾和擋風雨條，門口要安裝換氣扇。
4、在無人進入時關閉所有與外部相通的門。
5、把廢品放到特定存儲廢品的設備里。
6、從設備上移走舊的、不用的器材。
7、維護設備周圍及外部環境要有效控制蟲害產生和停留
8、妥善保存原料、產品和食品包裝材料。
9、及時清理生產過程中產生的外溢物和碎塊
10、使用可被食品加工設備接受并且不會污染食物、食品成分和食品包裝材料的殺蟲劑、陷阱、誘餌和化學藥品。化學藥品的控制和調節需由經蟲害控制培訓合格的工作人員執行或者依照國家法規進行。
11、在加工設備內外，對有老鼠陷阱及餌盒的特定區域，要制作一張辨識圖
三、生鮮食品廠的危險品管理
食品廠必須設置專用的危險品庫房、櫥柜，存放殺蟲劑和一切有害、有毒物品。這些物品必須貼有醒目的有毒標記。工廠應制訂各種危險品的使用規則。使用危險品須經專門管理部門核準，并在指定的專門人的嚴格監督下使用，嚴防污染食品。
四、環境監測
為了避免交叉污染，有計劃地檢測有菌區域，并確定清洗和消毒效果應采取下列步驟。
1、在食物接觸表面和非食物接觸表面（如排水溝）取樣。
2、確定合適的靶標微生物病原體、檢測區域及取樣頻率。該靶標微生物病原體對公共衛生具有重要意義，最有抵抗力的微生物，很可能出現在生鮮食品的生產中。
3、關注環境監測中的指示生物，例如李斯特菌，它能顯示微生物的污染，但不是病原微生物，并且它是比靶標微生物病原體更容易發現的微生物，例如單核細胞增生性李斯特菌。
4、建立在生產中使用的微生物測試方法，這種測試能顯示出靶標微生物或指示生物的存在。
5、證實正確的檢測結果，并且重復所有陽性微生物檢測結果。
五、衛生與質量檢驗管理
生鮮食品廠必須設有與生產能力相適應的微生物和質量檢驗室，并配備經專業培訓、考核合格的檢驗人員。檢驗室應具備檢驗工作所需要的場所和儀器設備，并有健全的檢驗制度。檢驗室應按照國家規定的檢驗方法（標準）抽樣，做物理、化學、微生物等方面的檢驗。凡不符合標準的產品一律不得出廠。