對于藥廠設計來說，凈化車間和設備的消毒處理是必須的環節，特別是對于某些設備或者墻角的角落來說，這些地方是最容易積塵和滋生細菌的，所以企業在進行藥廠設計的時候，首先就要考慮到這些情況，并且選擇合適的消毒劑。下面華盛興邦就談下在藥廠設計中消毒劑怎么選擇。
理想的化學消毒劑應具備如下條件：殺菌譜廣；有效濃度低；作用時間快；性質穩定；易溶于水；可在低溫下使用；不易受有機物、酸、堿及其他理化因素的影響；對物品無腐蝕性；無色、無味；消毒后易于去除殘留藥物；毒性低、不易燃燒爆炸，使用無危險性；價格低廉；便于運輸，可大量生產。但是，完全理想化的化學消毒劑是不存在的。在進行化學方法消毒（或滅菌）操作時，應盡可能選擇消毒效果可靠，對消毒對象影響較小，殘留較小或易于去除的消毒劑。
許多化學試劑能夠影響細菌的化學組織、物理結構和生理活動，從而發揮防腐、消毒、甚至滅菌的作用。
一、在國內消毒劑按照其殺滅微生物作用的強弱水平可以分為以下三種。
1、高效消毒劑可殺滅一切微生物，包括細菌芽孢。
2、中效消毒劑可殺滅除細菌芽孢以外的微生物。
3、低效消毒劑可殺滅細菌繁殖體可親脂性病毒，對真菌也有一定的作用。
二、在國外，消毒劑主要分為以下兩大類消毒產品。
1、滅菌劑：可以殺滅一切微生物，包括細菌芽孢，和高效消毒劑等同。
2、消毒劑：除了滅菌劑外的消毒產品通稱為消毒劑。
三、對于藥廠設計來說，在設計消毒/滅菌方法，或選擇消毒劑時，應考慮如下因素。
1、生物負荷
應對消毒/滅菌對象的生物負荷進行研究，包括區域內存在微生物的種類、微生物的數量等。
2、可接受標準
應明確微生物控制的可接受標準，如果目標是維持現有微生物水平，或者在一定時間內保證微生物不會顯著增加，那可接受標準就是消毒。如果目標是要殺滅所有微生物，使之達到或保持無菌狀態，那可接受標準就是滅菌。
3、目標消毒部位材質
目標消毒部位的材料可能會與所應用的化學劑發生反應。因此，目標消毒部位的材質與每一種消毒劑的兼容性都需要進行評估。
4、有機物質
有機物質的存在將對一些消毒劑的性能產生負面影響，如：目標部位表面有油性物質存在，酒精的消毒功效就會受到影響。如果遇到這種情況，就需要預先進行清潔處理，或者需要更長的作用時間。
5、作用時間
消毒劑要求一定的作用時間來完成它們的工作。要過多久消毒工藝才能徹底完成，生產和技術人員才能使用該區域，這點非常重要。
6、殘留
多數消毒劑會在它們所應用的表面留下殘留，應考慮殘留物質是否會對人員健康、生產工藝或目標部位造成負面影響，以及如何經濟、有效地去除殘留，同時也不會引入新的殘留物質
7、安全
要求在決定使用任何消毒劑之前，應獲取消毒劑（或主要成分）的安全技術說明書（MSDS），檢查相關的安全數據，如：毒性、致敏性、易燃易爆屬性等，并以此考慮是杏可以在目標區域內使用，或者因為使用了此類消毒劑，是否會改變目標區域的安全屬性（如：防火、防爆要求等）或其他管理性要求（如通風、人員防護等）。