制藥廠凈化車間是藥品生產的重要區域，我們要時刻保持凈化車間室內干凈衛生，制藥廠凈化車間的清掃與一般區域的清掃是不太相同的，下面華盛興邦就談下其清掃方式。
① 人工擦拭法：即人用潔凈室專用擦布和純水對制藥廠凈化車間的地、墻、頂以及家具和設備表面進行擦拭。這種清掃方法較為徹底。
② 分散式真空吸塵法：一般此方法只適用于低級別（1000級、10000級、100,000級）亂流潔凈室。方法簡單、靈活、方便，每天下班后均可采用此方法清掃。但由于移動式真空吸塵器內的圓筒形高效過濾器的效率比較低（≥99.5%，≥0.5μm），因此不適用在高級別的潔凈室。一般情況 500m2的制藥廠凈化車間可設兩臺吸塵器，每增加500m2增加一臺，最多不超過10臺。
③ 集中式真空吸塵法：集中式真空吸塵是一個由吸塵口、管網、集中吸塵泵、除塵器組成的系統。吸塵泵和除塵器設在專門的機房內，因噪聲極大，機房不但要遠離廠房和辦公區，而且還要適當地作隔聲消聲處理。吸塵泵應有備用不應少于 2 臺。系統的管道宜用無縫鋼管焊接聯接暗裝敷設。其彎頭曲率半徑為4 ~ 6d煨彎不得折皺，三通夾角要小于 45o，不應有四通（可由 2個三通組合），水平管道的坡度為 3‰，坡向立管和吸塵點，拐彎處宜設清掃口。系統末端為吸塵口，平時有蓋密封，使用時開蓋插入吸塵軟管進行吸塵。一般吸塵軟管作用半徑為 8 米，每個系統同時工作的吸塵口為 4~5個，每個吸塵口的風量為 150m3 /時。
集中式真空吸塵不會影響室內的潔凈度，因此，集中式真空吸塵方法多用在級別較高（100級、10級、1 級 ），面積較大的制藥廠凈化車間中。
潔凈室的清掃制度在一般情況下，每班（每天）小清掃一次；每周中清掃一次，每月大清掃一次。并且要設專人負責管理、監督和檢查。還要有一定的培訓制度。